隐睾的发生率在足月生产的男婴中为3.7%～5%，约50%的未降的睾丸在生后个月内下降到阴囊的正常位置。生后3个月隐睾的发生率降到0.97%～O.78%，6个月时下降到0.7%～0.8%。对青春期后或成年男人的大样本调查结果发现隐睾症病人仅为0.2%～0.3%，其中10%～15%为双侧;约20%的隐睾触摸不到，其中40%位于腹股沟管内，40%位于腹腔内，10%无睾丸存在。我国尚缺乏类似的系统深入的研究报道。

早产男孩中占30%。在性腺功能低下的患儿中隐睾的发生率也很高，对有血缘关系的6个家族的97名成员的调查结果发现21名性腺功能低减，其中6名合并隐睾(28.6%)，在男性性分化异常病人中隐睾的发生率可高达50%，而且未下降的睾丸常常发育不良。